黑龙江省有黑龙江、松花江、乌苏里江和绥芬河四大水系，有兴凯湖、镜泊湖、连环湖和五大连池4处较大湖泊及星罗棋布的泡沼。全省流域面积在50平方公里以上的河流有1918条，全省多年平均地表水资源量为686.0亿立方米，多年平均地下水资源量为297.44亿立方米，扣除两者之间重复计算量173.14亿立方米，全省多年平均水资源量为810.3亿立方米,人均水量2160立方米，均低于全国平均水平。
2005年全省年平均降水深为501.5毫米，折合水量2281.06亿立方米，比上年多15.3%，比多年平均少10.8%。2005年全省年平均径流深为116.7毫米，折合水量为530.6亿立方米。全省平原区地下水资源量为184.60亿立方米，山丘区地下水资源量为126.59亿立方米，山丘区与平原区重复计算量为11.13亿立方米，全省地下水资源量为300.06亿立方米。地下水资源与地表水资源重复计算量为143.58亿立方米，全省水资源总量为755.55亿立方米。全省总供水量为271.51亿立方米，其中地表水供水量158.43亿立方米，地下水供水量113.08亿立方米。
